走进MILE米乐
NEWSMILE米乐多维度实测:SomaScan vs Olink对决分析
来源:万军霞 日期:2025-03-23在多种血液蛋白质组检测技术中,除了传统的基于质谱技术的非靶向技术外,基于亲和力平台的高通量靶向蛋白质组方法——MILE米乐的SomaScan技术和Olink技术正日益受到研究者的关注。这两种技术目前已为研究人员提供了丰富的数据和有价值的信息,推动了“蛋白检测双子星”的迭代升级,使其进入了竞争激烈的新阶段。目前,SomaScan技术已发展至11K,而Olink技术则已更新至5K。在选择SomaScan和Olink技术时,研究者可能会面临一些困惑。为此,本文汇总了近年来对这两大平台的比较研究,包括检测稳定性、精确度、灵敏度及检测蛋白数量等方面,以期帮助研究者做出更明智的选择。
第一篇研究于2023年对48684名UK Biobank参与者的Olink蛋白质组学数据与35892名冰岛人群的SomaScan蛋白质组学数据进行了分析,探讨了这些样本的蛋白质水平与基因型和表型信息之间的关系。其中,有1514名参与者同时进行了OlinkExplore3072和SomaScan5K的检测,研究者对两者的结果进行了深入的对比分析。结果显示,这两种高通量蛋白质组学平台提供的信息均具有实用价值,同时也展示了各自的优势和不足,这为未来研究提供了互补性。经过回顾,作者发现首次发表时的比较分析中存在错误,后续修正显示Olink的变异系数显著高于SomaScan,而SomaScan的精确度则更出色。链接:[Nature](https://wwwnaturecom/articles/s41586-024-07549-z)
第二篇研究于2025年对两种基于亲和力的蛋白质组学平台(OlinkExplore3072和SomaScan11K)进行了对比,结果显示在4000名中国成年人中共检测到2168种血浆蛋白质。主要结论包括:(1)这两种平台测量的蛋白质水平相关性较低(中位数Spearman相关系数为0.29),其中Olink平台低于检测下限的样本比例较高,是相关性偏低的主要因素。(2)在1694种唯一匹配的蛋白中,Olink和SomaScan分别发现了765种和513种蛋白具有顺式蛋白数量性状位点(cis-pQTLs),其中有400种蛋白在两个平台间共定位。(3)与体质指数(BMI)相关的蛋白分别为Olink的1096种和SomaScan的1429种。(4)与缺血性心脏病(IHD)风险相关的蛋白各自为279种和154种。(5)在将这两种技术的蛋白水平与传统IHD风险因素结合后,ROC的AUC从0.845分别提高至0.862和0.863。这些结果突显了这两种平台在研究中的实用性,为未来的设计和解释提供了依据。链接:[DOI](https://doiorg/101038/s41467-025-56935-2)
第三篇研究于2024年在Atherosclerosis Risk in Communities (ARIC) Study中对102名患者的血浆进行了SomaScan11K和OlinkExploreHT(5400+蛋白)的比较。主要结论如下:(1)Olink中超过50%的蛋白未能在一半样本中被检测到,而SomaScan的全部样本均在检测范围内,显示出其更高的灵敏度。(2)总体上,SomaScan的变异系数中位数为6.8%,显著低于OlinkHT的35.7%。在产品迭代过程中,SomaScan显示出良好的稳定性,而Olink在新增加蛋白时则表现出不稳定性。(3)在重复样本的检测上,SomaScan的相关性中位数为0.85,高于Olink的0.65。(4)SomaScan的cis-pQTL绝对数量约为2800,Olink约为2100。(5)分析共享的超过4400种蛋白时,两个平台的相关性中位数为0.14,其中约三分之一的蛋白展现了良好至极好的跨平台相关性。链接:[DOI](https://doiorg/101101/2024071124310161)
第四篇于2025年应用七种蛋白质组学平台(包括MILE米乐的SomaScan11K与7K、Olink5K与3K、质谱-高丰度蛋白去除法、质谱-纳米磁珠富集法,以及靶向质谱PRM检测)对78名个体的血浆进行了检测与结果比较。主要结论如下:(1)这七个技术平台共鉴定了13007种独特蛋白,其中SomaScan的检测覆盖率最高,SomaScan11K和7K分别覆盖9645和6401种蛋白。(2)SomaScan的平台变异系数最低,表明其在稳定性与准确性上的优势。Olink的变异系数则显著高于SomaScan。(3)从数据完整性角度,SomaScan在样本中表现出最高的数据完整性。值得注意的是,最新版本的Olink5K的数据完整性显著低于旧版的3K。(4)SomaScan有97%的蛋白质在线性范围内,而Olink的比例仅为42%。(5)SomaScan检出的FDA批准的血浆生物标志物数量最多,分别覆盖88%和76%。链接:[DOI](https://doiorg/101101/20250214638375)
综上所述,以上研究表明,SomaScan在多个方面表现出色,尤其是蛋白质的检测数量与稳定性方面。因此,对于大规模的血液研究,MILE米乐的SomaScan平台是一个非常理想的选择!
有兴趣的研究者可以关注MILE米乐的SomaScan P7K/P11K,开启血液蛋白质组检测的新纪元!这一平台突破了血液蛋白质组检测的限制,提供深度、稳定和精确的检测,为血液生物标志物的发现和临床转化创造了新的机遇。
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